ال-گلوتامین یک اسید آمینه غیرضروری است که به‌طور طبیعی در بدن تولید می‌شود. اگرچه برخی نگرانی‌ها در مورد عوارض جانبی آن وجود دارد، اما تحقیقات نشان می‌دهند که در دوزهای توصیه‌شده، ال-گلوتامین به‌طور کلی ایمن است و عوارض جانبی آن نادر هستند. برخی از عوارض گزارش‌شده مانند مشکلات گوارشی خفیف، معمولاً در دوزهای بالا مشاهده می‌شوند و با رعایت دوزهای استاندارد، قابل پیشگیری هستند. تأثیرات منفی جدی بر کبد، کلیه، یا مو نیز تا کنون در مطالعات علمی تأیید نشده‌اند.